南崁兒童藝術村的前身為內政部北區兒童之家院長及員工宿舍，內政部北區兒童之家最早於 1946 在北投創立，當時名為「台灣省兒童保育院」。後因擴院需求而搬遷至蘆竹區中山路現址，並於長春路和吉林路口建造了和洋混和折衷風格之獨棟院長及二層連棟員工單身及有眷宿舍。
1946
1980~1990
因臺灣省議會決議，1980年改名「臺灣省立桃園育幼院」直至1989年7月，中央政府精省組織再造，臺灣省政府社會處及所屬機構改隸內政部，更名為「內政部北區兒童之家」。
國有財產局對內政部北區兒童之家宿舍用地另有使用規劃，於1999年收回院長及員工宿舍之土地，僅剩的住戶因此全部搬離。
2011
2011年，蘆竹鄉公所向國有財產局以有償撥用的方式取得用地，預計拆除宿舍群建築並規劃為國民運動中心。
2013
配合行政院組織調整，自2013年7月23日改隸衛生福利部，機關更名為衛生福利部北區兒童之家。
2013 年在地居民成立了「搶救南崁珍貴老樹老屋聯盟」，喊出「要綠地，不要灌水泥」的口號，並提出蘆竹國民運動中心採易地興建，以達成雙贏的方式，希望激起更多居民以及政府相關單位的重視，也終於在雙方長期的努力之下，此處珍貴的老樹老屋才得以完整的保留。
2014
2014年5月29日，當時的桃園縣政府正式公告「前內政部北區兒童之家院長宿舍」為古蹟；另於2015年8月17日桃園市政府公告登錄「前內政部北區兒童之家宿舍群」為歷史建築、2017年1月20日變更登錄範圍單身宿舍與有眷宿舍共4棟。
2016年起，桃園市政府文化局進行整體規劃設計及修復工程至2018年6月修復完成。
2018
2018 年 12 月，在匯集各方意見及長期企劃後，引進民間參與由人文國際股份有限公司取得營運權正式進駐兒童藝術村，以「親子、藝術、學習、美食」四大元素為主軸，活化再利用南崁兒童藝術村這塊珍貴的文化綠資產，與民眾共同營造具人文特色及藝術氣息的親子樂園！